La comunità ebraica di Merano comprende circa 50 membri. Nella Sinagoga si tengono regolarmente le funzioni religiose e nel Circolo culturale Anna Frank si tengono convegni, feste ebraiche e corsi di ebraico. Durante il periodo nazista dal settembre 1943 al aprile 1945 la Sinagoga era addibita a magazzino da militari tedeschi, però gran parte degli arredi si sono salvati.

Dal 1894 la Fondazione Königswarter invitò ospiti e abitanti ebrei di Merano ad assistere alle funzioni religiose nella sala di preghiera del Sanatorio ebraico, aperto nel 1893 con l'aiuto di donazioni pervenute da diversi paesi. Presto però si accorsero che la sala di preghiera era troppo piccola. Il curatore Rudolf Magnus quindi propose la costruzione di una Sinagoga. Con grande gioia del rabbino Aron Tänzer il 25 aprile 1900 i rappresentanti della Fondazione Königswarter annunciarono la costruzione di una Sinagoga sul terreno adiacente al Sanatorio ebraico. La costruzione e il progetto furono affidati agli architetti Musch & Lun. Tra gli ospiti ebrei in ferie a Merano furono raccolte offerte per un valore di 5.200 corone destinate al progetto della Sinagoga.